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案例分享|谷固醇血症2型

日期:2023/3/15 9:46:17 发布人:

01
临床信息

临床信息:受检者,男,6岁6个月。

临床表现发现血脂高2年余,CHOL(总胆固醇):9.29mmol/L↑,LDL-C(低密度脂蛋白胆固醇):6.55mmol/L↑,贫血。查体:矮小,面部苍白,右侧肘部、双膝关节可见黄色瘤。

家族史:/

检测项目家系全外显子组测序。


02
检测结果

1.jpg

检测结果:受检者携带2个致病变异:ABCG5基因NM_022436.3:c.[1336C>T];[1311C>G]复合杂合突变,与谷固醇血症2型相关。


03
详细解读

一代测序结果

2.png

3.png

变异评级:

c.1336C>T

致病

PVS1:无义突变,变异导致提前出现终止密码子,使其编码的蛋白在第446位氨基酸处发生截短,预测发生无义介导的mRNA降解(NMD)。

PM3_Very Strong:曾报道至少5名患者携带此变异:3名患者另一变异为致病/可能致病(c.[1336C>T];[751C>T]、c.[1336C>T];[9+2A>G]、c.[1336C>T];[830_848dup]);2名患者携带纯合变异。

PP4:变异携带者的表型或家族史高度符合某种单基因遗传疾病。

根据ESP数据库、千人数据库、gnomAD数据库分析,该变异位点的最高人群频率为0.0009。


c.1311C>G

致病

PM2_Supporting:根据ESP数据库、千人数据库、gnomAD数据库分析,该变异位点的最高人群频率为0.0002。

PM3_Very Strong:曾报道至少4名患者携带此变异,另一变异为致病/可能致病(c.[1311C>G];[1336C>T]、c.[1311C>G];[335_336insA]、c.[1311C>G];[987C>A]、c.[1311C>G];[751C>T])。

PP4:变异携带者的表型或家族史高度符合某种单基因遗传疾病。

生物信息学软件REVEL评分为0.535。


04
OMIM疾病介绍

谷固醇血症2型临床表现为血浆中的谷固醇水平高,肌腱和结节性黄色瘤、高胆固醇血症、早发动脉粥样硬化症和冠状动脉疾病,溶血性贫血和/或血小板减少,身材矮小,关节炎,关节痛和脾肿大等,呈常染色体隐性遗传,发病率小于1/1000000(数据来源:Orphant数据库)。

05
遗传咨询建议

ABCG5基因导致的谷固醇血症2型遗传模式为常染色体隐性遗传。送检者兄弟姐妹的患病风险取决于其父母该基因致病/疑似致病变异携带情况。如果送检者的父母双方均为该基因致病/可能致病变异的杂合携带者,其每个子女理论上均有25%的概率患病,50%的概率为杂合携带者。送检者的每个孩子均有50%的概率为杂合携带者。通常情况下,杂合携带者的患病风险与普通人群无异。

     如果在家族中已有人确认携带了上述致病/疑似致病变异,则可对有患病风险的高危亲属进行该变异的筛查。如符合相应指征,也可通过产前诊断或胚胎移植前遗传学检测(PGT)技术进行优生优育指导。


参考文献:

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