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bat365在线中国登录入口助力食管鳞状细胞癌放疗敏感性关键基因发现

日期:2022/9/29 9:17:28 发布人:

重磅!上海交通大学医学院附属仁济医院马秀梅主任团队在国际知名学术期刊Frontiers in Immunology(IF=8.786)在线发表最新研究成果。     

2022年9月2日,国际著名学术期刊Frontiers in Immunology在线发表上海交通大学医学院附属仁济医院题为“Identifying key mutations of radioresponsive genes in esophageal squamous cell carcinoma”的研究成果。本研究通过比较食管鳞状细胞癌放疗敏感组和不敏感组群体之间胚系突变和体细胞突变谱,鉴定出NOTCH1基因在调节食管鳞状细胞癌的放疗敏感性中起重要作用,可能成为食管鳞状细胞癌治疗中的重要候选生物标志物和潜在的治疗靶点。bat365在线中国登录入口所属南通中科医学检验实验室有限公司作为合作方为本研究提供了测序和个性化的生物信息分析服务。

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文章发表在Frontiers in Immunology

放疗是食管鳞状细胞癌(ESCC)的标准治疗中的重要方法,然而患癌人群对放疗的敏感性存在较大的个体差异,一些患者无法从放疗中获益。因此,如何对获益人群进行筛选,进行个性化的治疗至关重要,临床中亟需确定影响ESCC放疗敏感性的分子机制。

本研究将受试者分为放疗敏感组和不敏感组,分别进行癌组织和配对血液的肿瘤全外显子组测序,分析ESCC的胚系和体细胞突变。通过对候选基因进行功能富集分析和基于通路的蛋白质-蛋白质相互作用分析发现潜在的调控网络。通过测量ESCC细胞中CCK-8和LDH释放水平来测定放射治疗后的细胞存活和细胞死亡。此外,此研究还分析了ESCC中NOTCH1与肿瘤免疫浸润的相关性。

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研究表明,344个体细胞和65个胚系差异突变基因被检测为放疗敏感性相关基因。ESCC患者的肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)与放疗反应无显著相关性。基于通路的蛋白质-蛋白质相互作用分析表明,多个关键基因处于核心位置(如PIK3CA、NOTCH1、STAT3和KDR)。体外研究表明,在ESCC细胞中,NOTCH1表达的降低会抑制细胞存活,并诱导放疗后更多的细胞凋亡,而NOTCH1过表达具有相反的效果。此外,在ESCC中经常上调的NOTCH1与ESCC中活化的B细胞和未成熟的树突状细胞数目呈显著的负相关。NOTCH1的高表达伴随着一些免疫治疗相关细胞的减少,如CD8(+)T细胞和NK细胞。

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这些结果表明ESCC中放疗敏感组和不敏感组之间存在显著的胚系突变和体细胞突变频谱差异,NOTCH1在调节食管鳞状细胞癌的放疗敏感性中起重要作用,可能是提高食管鳞状细胞癌放疗敏感性的潜在的治疗靶点。

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参考文献:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2022.1001173/full


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